Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZS2

KLRF1, Killer cell lectin-like receptor subfamily F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLRF1Q9NZS2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
KLRF1Q9NZS2 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms