Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NKIRAS1Q9NYS0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms