Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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RDH8Q9NYR8 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RDH8Q9NYR8 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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