Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LMBRD1Q9NUN5 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LMBRD1Q9NUN5 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms