Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.689e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.799e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.849e-7■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.682e-6■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.152e-6■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.411e-8■■■■■ 141.2
UTP3Q9NQZ2 AP2A1-205ENST00000597774 2196 ntTSL 518.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 141.1
UTP3Q9NQZ2 AP2A1-202ENST00000359032 3286 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 141.1
UTP3Q9NQZ2 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.422e-7■■■■■ 141.1
UTP3Q9NQZ2 ULK1-205ENST00000541761 1262 ntTSL 216.66■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 BRD4-208ENST00000597315 892 ntTSL 528.72■■■□□ 2.198e-7■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.88e-7■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.618e-7■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.183e-8■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 RECQL5-216ENST00000582548 709 ntTSL 518.23■□□□□ 0.517e-13■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 CYP4F30P-201ENST00000397485 2209 ntTSL 210.05□□□□□ -0.81e-6■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 CYP4F30P-203ENST00000438109 2250 ntTSL 1 (best) BASIC8.59□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 141
UTP3Q9NQZ2 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-6■■■■■ 140.9
UTP3Q9NQZ2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.571e-6■■■■■ 140.9
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-203ENST00000618377 489 ntTSL 521.77■■□□□ 1.084e-9■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 AC087633.2-206ENST00000614581 513 ntTSL 510.17□□□□□ -0.784e-9■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.658e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 STK24-208ENST00000539966 9361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.288e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 STK11-208ENST00000591133 1011 ntTSL 219.92■□□□□ 0.785e-8■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-213ENST00000532085 5862 ntTSL 1 (best)18.95■□□□□ 0.624e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-204ENST00000525039 1780 ntTSL 1 (best)18.17■□□□□ 0.54e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-212ENST00000530407 1472 ntTSL 217.43■□□□□ 0.384e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-205ENST00000525102 2844 ntTSL 215.58■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.084e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-219ENST00000638360 1912 ntTSL 514.76□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-220ENST00000638925 2046 ntTSL 514.69□□□□□ -0.064e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.094e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 SLC37A4-210ENST00000527992 2040 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 140.8
UTP3Q9NQZ2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.567e-7■■■■■ 140.7
UTP3Q9NQZ2 PPAN-204ENST00000444703 757 ntTSL 327.99■■■□□ 2.072e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.151e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-218ENST00000485932 553 ntTSL 421.93■■□□□ 1.11e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.021e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.961e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-209ENST00000441904 878 ntTSL 320.87■□□□□ 0.931e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-208ENST00000441840 1854 ntTSL 520.67■□□□□ 0.91e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.871e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 HIP1R-202ENST00000452196 2054 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.821e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-215ENST00000458579 662 ntTSL 320.13■□□□□ 0.811e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-205ENST00000439815 561 ntTSL 419.45■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-216ENST00000464762 693 ntTSL 519.42■□□□□ 0.71e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-201ENST00000411855 1447 ntTSL 219.17■□□□□ 0.661e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-222ENST00000498733 1401 ntTSL 218.98■□□□□ 0.631e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.581e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.581e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-203ENST00000429716 1622 ntTSL 218.37■□□□□ 0.531e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 HIP1R-204ENST00000535831 3078 ntTSL 217.03■□□□□ 0.321e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 DBNL-202ENST00000423561 634 ntTSL 215.05■□□□□ -01e-9■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.022e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 METTL16-205ENST00000571669 5606 ntTSL 514.3□□□□□ -0.122e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.262e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-203ENST00000517880 1416 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-205ENST00000519780 707 ntTSL 511.47□□□□□ -0.572e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-201ENST00000265085 9483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-201ENST00000334667 2401 ntTSL 2 BASIC9.62□□□□□ -0.872e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.892e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.962e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.082e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-206ENST00000519467 1348 ntTSL 58.25□□□□□ -1.092e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 AL590705.5-202ENST00000375204 3161 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.162e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.22e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.522e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.562e-7■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.371e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.351e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.071e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-203ENST00000354532 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF1-220ENST00000600274 3439 ntTSL 1 (best)12.79□□□□□ -0.361e-6■■■■■ 140.6
UTP3Q9NQZ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.739e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 323.04■■□□□ 1.284e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 EXOC6-204ENST00000443748 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.841e-6■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 EXOC6-201ENST00000260762 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.791e-6■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 218.29■□□□□ 0.521e-6■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 316.25■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.332e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-206ENST00000537473 2939 ntTSL 214.99□□□□□ -0.012e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 140.5
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.191e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 140.4
UTP3Q9NQZ2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 140.4
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