Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
INCENPQ9NQS7 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
INCENPQ9NQS7 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms