Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
A4GALTQ9NPC4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
A4GALTQ9NPC4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.7 ms