Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CENPJQ9HC77 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CENPJQ9HC77 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms