Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
APOBEC3GQ9HC16 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms