Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TRIM8Q9BZR9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms