Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY4

RSPO3, R-spondin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPO3Q9BXY4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RSPO3Q9BXY4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms