Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
VN1R3Q9BXE9 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms