Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NIPSNAP1Q9BPW8 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms