Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PITX2Q99697 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms