Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX18Q96RF0 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms