Protein–RNA interactions for Protein: Q96M02

C10orf90, Centrosomal protein C10orf90, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf90Q96M02 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C10orf90Q96M02 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms