Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA4

MS4A14, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 14, humanhuman

Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A14Q96JA4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MS4A14Q96JA4 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms