Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
BORCS6Q96GS4 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms