Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ7

TM4SF19, Transmembrane 4 L6 family member 19, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF19Q96DZ7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TM4SF19Q96DZ7 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TM4SF19Q96DZ7 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms