Protein–RNA interactions for Protein: Q96BI3

APH1A, Gamma-secretase subunit APH-1A, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APH1AQ96BI3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APH1AQ96BI3 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APH1AQ96BI3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms