Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RFT1Q96AA3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms