Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NKD1Q969G9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms