Protein–RNA interactions for Protein: Q92901

RPL3L, 60S ribosomal protein L3-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3LQ92901 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RPL3LQ92901 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms