Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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PTPRUQ92729 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PTPRUQ92729 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
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