Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE85

GRHL3, Grainyhead-like protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL3Q8TE85 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GRHL3Q8TE85 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms