Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms