Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDZD4Q76G19 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDZD4Q76G19 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms