Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BRINP3Q76B58 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms