Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
BEND4Q6ZU67 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms