Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TSSK4Q6SA08 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TSSK4Q6SA08 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms