Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CCDC174Q6PII3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CCDC174Q6PII3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms