Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
DUPD1Q68J44 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms