Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ATG16L1Q676U5 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG16L1Q676U5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms