Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSP4

LCN1P1, Putative lipocalin 1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN1P1Q5VSP4 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LCN1P1Q5VSP4 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms