Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ODF2Q5BJF6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms