Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 KCNIP2-203ENST00000348850 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 CLCNKB-202ENST00000375679 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
ANKRD39Q53RE8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms