Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TMEM259Q4ZIN3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms