Protein–RNA interactions for Protein: Q499Z3

SLFNL1, Schlafen-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFNL1Q499Z3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SLFNL1Q499Z3 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms