Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL38Q2WGJ6 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms