Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
COL24A1Q17RW2 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL24A1Q17RW2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL24A1Q17RW2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL24A1Q17RW2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
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COL24A1Q17RW2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
COL24A1Q17RW2 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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