Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RTL8BQ17RB0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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RTL8BQ17RB0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
RTL8BQ17RB0 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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