Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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PTPRNQ16849 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTPRNQ16849 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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