Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FSCN1Q16658 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
FSCN1Q16658 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms