Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HLFQ16534 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HLFQ16534 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms