Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
GRIK5Q16478 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GRIK5Q16478 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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