Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ZIC1Q15915 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ZIC1Q15915 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms