Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VPS72Q15906 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
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