Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NPTX1Q15818 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NPTX1Q15818 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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