Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PDCD1Q15116 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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