Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PCOLCEQ15113 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PCOLCEQ15113 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms